底物相互作用预测
TransDSI基于图神经网络与迁移学习的蛋白质组级 DUB-底物相互作用预测,含残基级可解释图集。
适用场景 · Scenes
- 在蛋白质组范围内寻找某个去泛素化酶(DUB)的候选底物
- 验证 DUB 与底物之间是否可能存在相互作用
- 通过残基级可解释性定位决定相互作用的关键位点
使用步骤 · Steps
- 01阅读模型原理,了解 CT 编码、图自编码预训练和预测流程
- 02查看 USP10 × MDM2 演示案例和性能、可解释性图集
- 03需要预测自己的 DUB 或底物清单时,登录后提交工单说明需求
- 04由本地高配机器代跑,交付预测分数和可解释性图(模型不支持在线运行)