/ 从问题到结果一条序列,
一条序列,
一个可以开始的方向。
先用示例数据看懂结果,再带入自己的研究。预测分数、位点分布与结果表,放在同一个工作台。
预测 /位点预测任务 #1042 · 已完成示例
位点预测 · 结果
示例序列 · TDP-43 N 端 1–144阈值 0.65导出 CSV序列视图 高 / 中置信位点已标出
001MSEYIRVTEDEN DEPIEIPSEDDG
025TVLLSTVTAQFP GACGLRYRNPVS
049QCMRGVRLVEGI LHAPDAGWGNLV
073YVVNYPKDNKRK MDETDASSAVKV
097KRAVQKTSDLIV LGLPWKTTEQDL
121KEYFSTFGEVLM VQVKKDLKTGHS
候选位点 按概率排序
| 位点 | 概率 | 置信 |
|---|---|---|
| K114 | 0.81 | 高 |
| K102 | 0.79 | 高 |
| K82 | 0.71 | 中 |
| K84 | 0.66 | 中 |
| K121 | 0.56 | 中 |
11赖氨酸位点
4高于阈值
2高置信 ≥ 0.75
5中置信 0.50–0.75
沿序列的乳酰化概率 残基 1–144 · 示例
粘贴一条序列,逐个赖氨酸给出乳酰化概率 —— 下面每一屏,都是工作台里真实存在的工具(界面为示意,数据均为示例)。
/ 产品从序列到成图,
从序列到成图,
五条产品线。
蛋白、组学、结构、文献、图表。每个工具都附示例数据,打开就能看到结果。
- 01蛋白预测
- 02组学数据
- 03结构与模拟
- 04文献智能
- 05科研图表
预测 /相分离预测示例
相分离预测
示例 · TDP-43 · 位点级 + 区域级区域模式:自动识别 IDR沿序列的相分离倾向 圆点为修饰位点
示例 · K1140.81乳酰化概率 · 高置信
组学 /共识聚类示例
共识聚类
TCGA-LUAD · 示例基因集k=2k=3k=4共识矩阵 k=3
各分型生存曲线 示例
组学 /GEO 数据集示例
GEO 数据集
关键词:lactate metabolism导出清单| 数据集 | 物种 | 类型 | 样本 |
|---|---|---|---|
| GDS· 示例 01 | Homo sapiens | 表达谱 · 芯片 | 24 |
| GDS· 示例 02 | Mus musculus | 表达谱 · 芯片 | 12 |
| GDS· 示例 03 | Homo sapiens | 表达谱 · 芯片 | 36 |
| GDS· 示例 04 | Rattus norvegicus | 表达谱 · 芯片 | 8 |
03 · Structure & Dynamics
结构与模拟
PISA 计算复合物界面的面积、溶剂化自由能与关键残基。GROMACS 提供从体系搭建到轨迹分析的成套流程,在你自己的 GPU 上运行。
了解结构与模拟 →结构 /PISA示例
PISA 界面分析
示例结构 · 3 条链| 界面 | 面积 Ų | ΔG kcal/mol | CSS |
|---|---|---|---|
| A ↔ B | 1 284 | −14.2 | 0.71 |
| A ↔ C | 862 | −8.9 | 0.42 |
| B ↔ C | 540 | −5.1 | 0.18 |
结构 /GROMACS示例
GROMACS · 分析
示例体系 · 100 nsRMSD nm
RMSF nm
GROMACS从搭体系到轨迹分析成套流程与脚本,在你自己的 GPU 上运行
文献 /AI 文献助手示例
TDP-43 的相分离与哪些致病突变有关?
已检索 PubMed,相关研究集中在三方面:C 端低复杂度区突变1、应激颗粒中的聚集2,以及与 ALS 病理的关联3。摘要与原文链接见右侧。
引用文献 可存入文献库
[1]低复杂度区突变 · 研究
[2]应激颗粒与聚集
[3]ALS 病理 · 综述
文献 /文献库示例
PubMed 文献库
按专题归档 · 示例PMID / DOI 检索| 专题 | 文献 | 更新 |
|---|---|---|
| 相分离与修饰 | 12 篇 | 最近:今天 |
| 肿瘤分子分型 | 8 篇 | 最近:本周 |
| 蛋白界面 | 5 篇 | 最近:上周 |
/ 工作流一次分析,
一次分析,
四步。
你负责数据和判断。计算和排队交给平台。
- 01
放入数据
粘贴序列,上传结构或表达矩阵。没有数据,就先载入示例。
已载入示例数据 - 02
提交
任务进入队列,进度实时可见。
运行中 · 62% - 03
读结果
需要时,把位点送进相分离预测继续分析。
送往相分离预测 → - 04
导出
图导出 TIFF / SVG,表导出 CSV。
TIFFSVGCSV
/ 平台分析做完,
分析做完,
接着往下走。
- 01
代跑与定制
算力不够或需要定制分析,提交工单,由我们运行后交付结果。
- 02
文献库
检索和问答中找到的文献,按专题归档。
- 03
工具互通
乳酰化预测得到的位点,可以直接送去相分离预测。
- 04
投稿格式
矢量图与高分辨率位图;结果表保留全部字段。
/ 方法与来源用到的方法,
用到的方法,
都有出处。
- 位点预测PCBert-KlaProtBert 表征 + 理化特征
- 共识聚类ConsensusClusterPlusTCGA
- 界面分析PDBePISAEBI
- 分子动力学GROMACS 2025流程与脚本
- 底物互作TransDSI图神经网络 + 迁移学习
- 文献与数据PubMed · GEO DataSetsNCBI
上列为所用方法与公开数据来源,不代表合作或背书。
/ 常见问题
常见问题
需要编程基础吗?
不需要。大部分工具在浏览器里点选完成;GROMACS 提供成套脚本,在你自己的 GPU 机器上运行;底物互作预测由我们代跑。
不注册能用吗?
可以先看示例:大多数工具不登录就能浏览,并用示例数据查看结果。提交任务需要登录;生信图表、随机数、文献库登录后使用。
结果能写进论文吗?
图导出 TIFF / SVG,表导出 CSV。预测结果需经实验验证。
计算量大的任务怎么办?
长时程分子动力学、底物互作预测等,可以提交工单,由我们运行后交付结果。


