共识聚类

Cluster

表达矩阵做 ConsensusClusterPlus 共识聚类,选 K 出图,得到分子分型。

适用场景 · Scenes

  • 基于一组基因对 TCGA 癌种样本做分子分型
  • 判断样本聚成几类最稳定(k 的选择)
  • 比较不同分型之间的生存差异

使用步骤 · Steps

  1. 01选择癌种,上传单列基因集
  2. 02提交聚类,页面显示各 k(2–9)的共识矩阵等过程图
  3. 03根据过程图挑选合适的 k
  4. 04生成该 k 下的生存曲线,并下载图表和分型 CSV(可反复切换 k)

同组工具:分析工具