工具 · Tools
科研工具库
从文献到图表、从结构到模拟,按研究流程分组。大多数工具游客可先看,用到上传和运行时再登录工作台。
共 14 个工具
分析工具
结构、修饰位点、分型与模拟,一个入口。
乳酰化位点预测
Kla上传 FASTA 序列,基于 PCBert-Kla(ProtBert + 物化特征融合)预测赖氨酸乳酰化位点。
FASTA 序列 → 位点预测表
可先看示例,提交任务需登录
PTM 相分离预测
PTM预测翻译后修饰对蛋白相分离倾向的影响,输出位点级与区域级分析及配套图表。
FASTA + 位点 → 位点 / 区域 / 图表
可先看示例,提交任务需登录
PISA 结构分析
PISA上传 PDB 结构,直连官方 PISA 批量解析蛋白-蛋白界面参数(ΔG、CSS 等)。
PDB 结构 → 界面参数 / 结果包
可先看示例,提交任务需登录
共识聚类
Cluster表达矩阵做 ConsensusClusterPlus 共识聚类,选 K 出图,得到分子分型。
表达矩阵 / 基因集 → 分型 / 图表
可先看示例,提交任务需登录
检索 GEO DataSets,按条件筛选后导出结果清单。
关键词 / 条件 → 数据集清单
可先看示例,提交任务需登录
分子动力学模拟
MDGROMACS 2025 全流程模拟说明与脚本:体系构建、生产模拟、自由能分析与图表导出。
PDB + 配体参数 → 轨迹 / 自由能 / 分析图
可先看示例,提交任务需登录
底物相互作用预测
TransDSI基于图神经网络与迁移学习的蛋白质组级 DUB-底物相互作用预测,含残基级可解释图集。
蛋白 / 组学 → 相互作用 / 图集
可先看示例,提交任务需登录
随机数生成器
Random按分布与精度批量生成随机小数 / 整数,支持固定种子复现,用于随机分组与抽样。
分布 / 种子 → 随机序列 / CSV
需登录使用
生信图表
常用生信图表在线绘制,后端 R 渲染。
生信图表
Charts覆盖分布与组成、差异、富集、生存与临床、矩阵与聚类、集合与位点六类共 37 种图,带示例数据,导出 TIFF / SVG。
矩阵 / 表达数据 → TIFF / SVG 图表
需登录使用
文献工作台
问一句,查文献、读 PDF、画图表。
用问的代替检索式:AI 替你翻 PubMed、读 PDF、画科研图表,也能指路该上哪个数据库;检出的文献可归档成专题。
一句话问题 / PDF → 文献清单 / 入库 / 图表 / 站点
可先看示例,提交任务需登录
PubMed 检索与文献库
PMID粘贴 PMID / DOI 列表,解析去重并标记期刊分值,筛选出值得精读的文献。
PMID / DOI 列表 → 文献清单 / CSV
可先看示例,提交任务需登录
按主题与年份检索专刊,只打包开放获取全文。
主题 / 年份 → OA 全文包
可先看示例,提交任务需登录
我的文献库
Corpus已入库文献的统一检索与管理,自动去重,CSV / JSON 导出。
速读结果 → 文献库 / 导出
需登录使用
常用网站导航
按研究流程整理的科研网址直达,游客可看。
科研网站导航
Nav文献检索、基金选题、生信数据库、科研绘图、选刊投稿等 18 个环节、150 余个常用站点,站点图标自动取自域名;登录后可收藏书签。
研究流程 → 常用网址直达
可先看示例,提交任务需登录